【行业】KRAS行业深度报告-云深方知归处(52页)
REVOLUTION MEDICINES开创性地开发了“三复合物”平台:通过一个伴侣蛋白(亲环蛋白A)与靶蛋白形成复合物,从而人为地创造出一个口袋供小分子抑制剂结合上去,形成一个“靶蛋白-小分子抑制剂-伴侣蛋白”的三复合物。小分子可以直接抑制RAS(ON)蛋白,伴侣蛋白结合上去也可以在空间结构上阻止RAS(ON)蛋白与下游效应蛋白结合、从而抑制下游信号传导。
以SOS::RAS抑制剂为例,研究者发现DCAI口袋是SOS1与RAS结合的关键位点。DCAI可以微弱抑制由SOS1蛋白介导的RAS核苷酸交换,共晶分析显示DCAI结合在KRAS的α2螺旋以及β折叠中间的一个口袋上,这个口袋也被称为DCAI口袋,结合在这个口袋的小分子可以抑制RAS和SOS1蛋白的结合,从而抑制SOS1介导的RAS由结合GDP向GTP的转化,将RAS锁定在GDP结合的失活态。代表药物如Boehringer的BI 2852。
EGFR与受体结合后发生二聚化,其后通过自我磷酸化自我激活,然后招募SOS1蛋白来到细胞质膜上与自己结合;然而SOS1蛋白结构域与EGFR结构域不匹配,需要GRB2蛋白帮助( GRB2 作用类似于转换插头,将不配套的SOS与EGFR结合),EGFR-GRB2-SOS1三者形成复合体,SOS1具备GEF能力,可以将与RAS结合的GDP交换出来,允许RAS与GTP结合,从而激活RAS蛋白;SHP2蛋白的作用目前不甚清晰,但是有假说认为SHP2是作为骨架蛋白,将GRB2和SOS1蛋白结合其上,同时还可以提高核苷酸交换速率。